Johannes Mihkelsoni Keskus (JMK) püüab tasakaalustada Eesti ühiskonda, aidates esindamata või ebavõrdsemas seisus olevaid ühiskonnagruppe (pikaajalised töötud, varjupaigataotlejad, sõltlased jt), suurendades kodanike teadlikkust ning osaledes poliitikakujundamise protsessis.
JMK osaleb AKÜ tegevustes Eestis toetades maailmahariduse, sallivuse ja kodanikuaktiivsuse ideede levikut ja arendamist. Koostöös teiste võrgustiku liikmetega arendab JMK oma tegevusi varjupaigataotlejate ja pagulaste abistamisel ning integreerimisel.